Институт стратегических исследований Республики Башкортостан образовано распоряжением Правительства Республики Башкортостан.
Основной целью деятельности Института является проведение фундаментальных и прикладных исследований по проблемам социально-экономического, общественно-политического и социокультурного развития Республики Башкортостан.